美國投放原子x和蘇聯出兵后，日本宣布無條件投降。1945年8月16日，日本組成了負責投降事務的東久邇內閣。日本從此進入在美國主導下的國家改造和民族改造。
　
    作為亞洲的一個傳統國家，日本在第二次世界大戰以前，從意識形態角度講，很大程度上還是一個停留在古代的封建制國家。在科學已經十分發達的20世紀，日本的統治者還在以類似中世紀的封建統治思想教化國民，宣揚天皇是神的化身。日本的國民被訓練成了惟命是從的動物；日本的軍人被告知，他們在戰場上為國家、為天皇而死恰如櫻花墜地，戰死者便已成神，因此他們相信憑借自己手中的軍x能夠打敗坦克。即使是在戰前的和平時期，軍國主義教育也是鼓吹所謂“大和民族”的“武士道精神”。為了培養“武士道精神”，日本的小孩子要從小學習忍耐和冒險精神，男孩子要常常赤腳在雪地中行走，練習劍道和柔道，半夜里到墳地里去，整夜整夜地處于“枕戈待旦”的狀態。

為此，美國對日本改造的當務之急放在了意識形態上。1945年6月11日，美國國務院、陸軍部和海軍部協調委員會制定了《戰后初期美國對日政策》的SWNCC150號文件。文件提出要鏟除日本人心目中的軍國主義思想和極端民族主義思想。這個委員會在隨后的文件中進一步提出“必須鼓勵日本人民培養起爭取個人自由，尊重基本人權，特別是宗教、集會、言論和出版自由的愿望”等內容。這些文件在經過大量文字修改后，經美國總統杜魯門批準，于9月22日公開發布。 根據《戰后初期美國對日政策》的精神，美國占領當局頒布了一系列旨在促進日本政治民主化的命令。9月10日，盟軍最高統帥麥克阿瑟對日本政府下達了關于言論和新聞自由的命令。26日，又下達了取消一切通信自由的限制，并鼓勵日本人民批評政府的政策。10月4日，盟軍最高統帥部頒布了題為《撤消對于政治自由和其他自由的限制》的命令，廢除了日本所有限制基本人權的法律和法案。這項命令后來被人們稱為日本的“人權法案”。10月4日，占領當局發出了“廢除對政治、民權及信仰自由的限制”法令。10日，又釋放了全部在押政治犯。
 
    為了便于改造，美國首先在日本重建了上層建筑。1945年8月28日，盟國駐日占領軍司令部成立。司令部下設參謀本部以及民政、法務、經濟、科學、民事通訊、自然資源、統計資料、民間情報、教育和公共衛生9個局，所有人員均由美軍擔任，在地方再設8個軍政部。美國不實行直接統治，而是通過天皇和日本政府實行間接統治。麥克阿瑟有權隨時改變日本政府和更換政府人員，實際上成了日本的太上皇。 1945年9月2日，麥克阿瑟發布第一號命令，宣布解散日本的陸軍、海軍和空軍，解除所有日本軍隊武裝并復員；強行規定軍工廠停產，廢棄有戰斗力的軍備。至10月15日，通過日本政府解除了336萬軍隊的武裝；海外375萬日本軍隊的解散和復員，直到1946年才基本完成。
 
    而后，美國開始對日本進行有條不紊的洗腦。1946年1月8日，美國國務院、陸軍部和海軍部協調委員會又制訂了一份題為《日本人再定位》的機密文件，編號為SWNCC162/2。這份文件指出，以麥克阿瑟為首的盟軍最高統帥部所下發的有關指令和采取的措施都是正確和有效的，所解決的只是美國占領日本時期日本的政治民主化問題。但要真正解決長遠問題就必須包括兩方面內容：一是要把政治改革的成果用憲法的形式固定下來；二是要對日本國民進行脫胎換骨的教育和改造。美國人對戰前的日本社會作了評估，認為在日本人頭腦中廣泛存在著這樣幾種觀念：頑固的封建主義觀念，包括等級差別、崇尚武力和屈從權威；盲目相信日本大和民族具有充當世界領導的優越品質，特別是對天皇的極端崇拜以及軍國主義的影響等。麥克阿瑟曾經講過一個笑話：給日本士兵發幾片藥，告訴他們日服3次，他們一有機會就把藥扔掉。但如果在盒子上寫明“天皇要求他們每天服用3次”，那么他們便會老老實實地按照指示服藥。 美國人意識到：要想從根本上消除日本人頭腦中的這些痼疾，決非一朝一夕之功。為此，美國占領當局在文件中制訂了周密的計劃，在意識形態領域對日本人頭腦中的痼疾開戰。

    這場洗腦戰的最大特色是以日治日。美國人沒有把這場意識形態領域的“戰爭”設計為美國人對日本人的戰爭，而是采取了日本人對日本人，更準確地說是代表美國利益的日本人對日本人的戰爭。因此，美國人特別要求“要利用日本自己的領導人來同日本人打交道。“美國相信會有很多日本人由于早期的經歷和教育，將成為美國利益在日本的代理人，而美國占領當局的一個基本責任就是要尋找這樣的人士，并保證把他們安插在適當而又重要的崗位上，這將有利于他們能夠完成對日本人的再定位和再教育工作。美國占領軍當局要為這些人提供咨詢、保障和支持。”進駐東京之初，麥克阿瑟就曾宣布：“最高統帥部的職責并非抑制日本，而是使它重新站起來……我們將利用日本政府這個工具來實行占領。”

為達此目的，美國人決定讓日本人對自身有個清楚認識，而且，這種認識主要應當通過在意識形態領域的控制和影響來完成。一方面，應當利用美軍占領日本的有利形勢，對日本的國民教育體制進行全面改造，通過對日本的年輕人進行西方式教育，灌輸西方價值觀；另一方面，將再教育的范圍從青年人逐步擴大到全體日本國民。在文件中，美國人提出：“要注意尋找一種方式，即通過每一種可能的渠道把再定位或再教育的概念輸入每個日本人的大腦。”為了達到這個目的，要利用一切傳播媒介，如：圖書、教材、期刊雜志、電影、廣播、報紙、講座、辦研討班以及各類學校的講臺等。文件特別強調，“必須認真地研究和考慮使用方法和恰當的材料。在具體操作過程中應盡量使用說服的辦法，避免使用說教，也要隨時注意日本人的接受程度”。在宣傳媒介中，應當“間接”而不是直接地向日本人頭腦中灌輸美國式的政治民主意識。在當時，日本廣播協會（NHK）的幾個主要節目，如“知識對話”、“左鄰右舍”、“農家傍晚”和“工會時刻”等的播出內容，都是先由美軍總廣播科計劃并草擬內容提綱后，再以日本廣播協會名義播出的。
 
事實上，意識形態改造必須深入到具體生活中，因此，在占領日本后，盟國逐步對日本社會進行改造，建設現代化的電話系統，引進合格的廁所和衛生設施，樹立現代的營養和衛生觀念，進行土地改革，廢除租佃制，將土地分給農民，將這個國家中的封建成分逐步清除。同時，清除日本上層建筑中的封建色彩，肅清日本軍國主義分子賴以發動戰爭的土壤，為日本社會注入現代社會的精神。
 
思想的源頭在教育和宗教，因此，1946年1月，美國占領軍總部發出了《關于教育根本改革的備忘錄》，提出了關于改造日本教育的具體意見和實施要點，其中包括：宗教（特別是神道教）同教育分離；為清除日本教育中央集權式管理影響而把教育權移交給地方政府，實施九年制義務教育等。1947年3月，美國占領當局公布了《學校基本法》和《學校教育法》。這兩個法案都強調了個人的主動性和探索性的重要性，建立以個人價值追求為中心的西方價值觀念。宗教方面，1946年10月4日，盟軍最高統帥部頒布指令，廢除日本戰前的《宗教團體法》，規定不得侵犯思想自由和信仰自由；保證公民享有宗教自由；嚴格禁止日本各級政府支持神道教，公共基金不能用于神道或用來修建神道的神祠；禁止宣傳或傳播神道或其它宗教教義中的軍國主義思想和極端民族主義思想，不允許在各級學校中講授神道教義等。同時，美軍占領當局還鼓勵美國國內和世界各地的基督教傳教士來日本傳教，擴大基督教在日本的影響。
 
為了利用天皇，美國決定限制和保留天皇制。1945年10月6日，美國國務院和陸海軍共同擬定了SWN55/3號文件，決定先把天皇制和裕仁天皇個人分開，然后考慮新憲法問題。1946年1月1日，天皇裕仁發表了《關于建設新日本的詔書》，即所謂“人的宣言”。在這份宣言中，裕仁宣布自己是人，而不是神，從而自我否定了天皇擁有神權和日本民族負有統治全世界使命的神話。 1946年11月，日本天皇頒布了戰后日本的新憲法，即“和平憲法”。憲法規定：天皇是世襲國家元首，而統治權在人民手中；日本完全放棄戰爭，禁止擁有軍隊；廢除華族（貴族）的一切特權。據說當麥克阿瑟的助手阿爾蒙德將軍把新憲法的草案交到時任日本首相的吉田茂手中時，吉田茂只說了一句話：“這無異于革命！”

作為對日本戰爭責任進行清算的重要方面，1946年在東京建立了遠東國際軍事法庭，負責對東條英機等28名甲級戰犯進行審判；在橫濱、馬尼拉、南京、新加坡等地設立法庭，對受到起訴的乙級和丙級戰犯進行審判。據統計，被盟國起訴的各類戰犯總數為5423人，被判刑者4226人，其中有941人被判處死刑。
 
戰后美國對日本的改造對日本來說是繼明治維新以來，日本的又一次大變革。如果說前一次變革（明治維新），是基于西方壓力作出的反應與選擇，那么第二次變革（戰后改革）則是掃除日本軍國主義，摧毀前“大日本帝國”而進行的全面強行改革。“明治維新”是日本主動從西方引進君主立憲的專制制度，而戰后改革是西方社會向日本強行導入現代民主制度。

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