農業養殖用地申請流程：1、計劃養殖者需持設施農用地建設方案及用地協議向所在地鄉鎮政府提出用地申請。2、鄉鎮政府依據設施農用地管理的有關規定對經營者提交的資料進行審查，符合要求的，由鄉鎮政府牽頭，會同區國土、農業、畜牧、環保等部門及計劃養殖者對項目用地進行現場踏勘。畜牧部門具體審核畜禽養殖場規模布局及畜禽種類是否符合畜牧規劃要求。符合規定要求的，由鄉鎮政府報區政府審批。3、經區政府批準后，計劃養殖者方可建設生產設施用地，而后經國土部門會同相關部門初驗符合設計要求的，國土部門向經營者頒發設施農用地備案通知書，計劃養殖者方準建設附屬設施用地。《中華人民共和國土地管理法》第二十五條：經批準的土地利用總體規劃的修改，須經原批準機關批準；未經批準，不得改變土地利用總體規劃確定的土地用途。 經國務院批準的大型能源、交通、水利等基礎設施建設用地，需要改變土地利用總體規劃的，根據國務院的批準文件修改土地利用總體規劃。 經省、自治區、直轄市人民政府批準的能源、交通、水利等基礎設施建設用地，需要改變土地利用總體規劃的，屬于省級人民政府土地利用總體規劃批準權限內的，根據省級人民政府的批準文件修改土地利用總體規劃。