有限公司分公司入股有效嗎?不可以，分公司不具有法人資格,不是適格的民事權利主體。分公司不是企業法人,也不能成為合伙人，沒有法人財產權,不是持有股權的適格主體。只要公司一方有增加股東的必要,投資方有購股投資的意思,雙方一經合意,建立認購契約,即告入股。入股雖以契約方式進行,但不是私下約定(不具有法律保護)的契約關系。必須按有關法律及公司章程辦理.新入股的股東,對于未入股前公司債務也應負責，有限責任公司或股份有限公司設立的分公司不具有企業法人資格,其民事責任由該總公司承擔。二、總公司和分公司的區別有哪些?總公司管理分公司,對所屬分公司在生產經營、資金調度、人事管理等方面行使指揮、管理、監督的權利，具有法人資格，可以獨立承擔民事責任。分公司是與總公司相對應的法律概念，是指在業務、資金、人事等方面受總公司管理，不具有法人資格的分支機構。分公司在法律、經濟上沒有獨立性，屬于總公司的附屬機構。1、分公司沒有自己的獨立財產，其實際占有、使用的財產是總公司財產的一部分，列入總公司的資產負債表。2、分公司不具有法人資格，不獨立承擔民事責任。3、分公司的設立程序與一般意義上的公司設立程序不同，設立分公司只需辦理簡單的登記和開業手續。4、分公司沒有自己的公司章程，沒有董事會等公司經營決策機構。5、分公司名稱為總公司名稱后加分公司字樣，其名稱中雖有公司字樣，但不是真正意義上的公司。6、分公司不獨立承擔民事責任，沒有董事會等形式的公司經營決策和業務執行機關，總公司要對分公司的債務負無限責任。綜上所述，現在很多大型公司都設立分公司，和子公司不同，分公司沒有獨立法人地位，不具備民事行為主體資格，因此分公司不能獨自投資入股，簽訂的投資入股協議無效。分公司可以用總公司的名義投資，通過總公司投資，總公司成為投資方。