有關(guān)遲到扣工資的具體法律依據(jù)已被廢止，但是，并不是說員工遲到，用人單位扣工資就是不合法的，是否合法要看具體情況。(1)首先，法律既要維護勞動者的合法權(quán)益，又要考慮保障企業(yè)和雇主進行正常、有效的勞動管理和企業(yè)管理，維護企業(yè)和雇主的合法權(quán)益。法律對維護職工合法權(quán)益和提高企業(yè)管理效益二者都要兼顧；(2)其次，勞動者肆意遲到等行為應(yīng)屬于違反勞動紀律，用人單位應(yīng)當有權(quán)在規(guī)章制度或企業(yè)獎懲制度中，對此類行為進行一定的處罰，以實現(xiàn)雙方的權(quán)利義務(wù)平等。如果用人單位有關(guān)員工遲到扣工資的規(guī)定符合這三個條件的情況下制定是不違法的。1、一是要經(jīng)職工討論。2、二是公示或者告知職工。3、三是不得違反法律法規(guī)的規(guī)定。以下5點公司不得扣員工工資：1、員工沒有按時完成工作任務(wù)(1)很多公司會與員工簽訂這樣的協(xié)議或者寫入公司規(guī)定:如果員工沒有按時完成工作任務(wù)，比如說好的賣出多少東西沒做到，就按一定的比例扣除員工的工資。(2)這種協(xié)議是不具有法律效應(yīng)的，《勞動法》規(guī)定：只要員工提供了正常的勞務(wù)，并且在勞動中無懶散等不良行為，公司就不能對員工罰款，應(yīng)該全額發(fā)放工資。2、員工因不可抗因素遲到早退員工無故遲到早退曠工公司當然是可以根據(jù)規(guī)章罰款，但法規(guī)規(guī)定：員工因不可抗因素(例如地震、水患、火災(zāi)等)而出現(xiàn)上述行為時，公司不能克扣員工工資。3、員工辭職未提前一個月通知如果員工的“通知離職日期”沒有比“擬離職日期”提前一個月，公司應(yīng)該根據(jù)實際情況處理，但無論如何不能以此為由克扣員工工資。4、女員工孕期頻繁請產(chǎn)檢假(1)很多公司都規(guī)定了產(chǎn)假的期限，一般都比較充足。但一些不成熟的小公司沒有相關(guān)規(guī)定，當女員工孕期要頻繁請假去檢查時，有的老板就開始犯嘀咕了，想以員工請假次數(shù)太多來扣工資，這也是不合法的。(2)《女職工勞動保護特別規(guī)定》規(guī)定：孕期請假檢查不但不能扣工資，公司還應(yīng)該將這些時間計入該女員工的勞動時間，算正常出勤，不能按病假、事假、曠工等來處理。5、員工被“強行”捐贈有的公司會和一些公益組織合作，或者經(jīng)常自己搞一些公益活動，捐款捐物。也會號召員工捐款，并直接從工資扣除，這更是不合法的。《公益事業(yè)捐贈法》規(guī)定：員工有權(quán)自行決定是否捐款以及捐款的數(shù)額，并且應(yīng)自行處理捐出的財物，公司不能直接從員工工資里扣除。如果用人單位以遲到、請病假等為理由扣除員工的工資的，員工可以進行投訴，或者是向勞動仲裁委員會申請勞動仲裁，請求單位支付足額的工資，如果單位拒不支付的，可以向人民法院提起訴訟，請求人民法院裁決，并申請強制執(zhí)行，從而拿回自己應(yīng)得的勞動報酬。