一、檢察院做出存疑不起訴的情形存疑不起訴，又稱證據不足的不起訴。存疑不起訴是指檢察機關對于經過補充偵查的案件，仍然認為證據不足，不符合起訴條件的，可以作出不起訴決定。我國刑事訴訟法第171條第4款規定：對于二次補充偵查的案件，人民檢察院仍然認為證據不足，不符合起訴條件的，應當作出不起訴的決定。而根據我國刑事訴訟法第171條第三款規定的精神，補充偵查的案件應在1個月內補充偵查完畢，補充偵查以兩次為限。因此，經過兩次補充偵查，對于事實仍未查清、證據不足的案件，人民檢察院可以作出不起訴的決定。案件經過兩次補充偵查，具有下列情形之一，不能確定犯罪嫌疑人構成犯罪和需要追究刑事責任的，屬于證據不足，不符合起訴條件。(1)據以定案的證據存在疑問、無法查證屬實的。(2)犯罪構成要件事實缺乏必要的證據予以證明的。(3)證據之間的矛盾不能合理排除的。(4)根據證據得出的結論具有其他可能性而無法排除的。二、決定存疑不起訴注意事項人民檢察院根據上述情形作出不起訴決定后，如果發現了新的證據，證明案件符合起訴條件時，可以撤銷不起訴決定，提起公訴。對于存疑不起訴應當注意的是，只有案件經過兩次補充偵查后，人民檢察院仍然認為案件事實不清、證據不足時，才可以作出不起訴決定。因此，案件經過兩次補充偵查和案件事實不清證據不足，是刑事訴訟法規定的存疑不起訴的必要條件，人民檢察院必須嚴格執行，只有這樣，才能既可以防止放縱犯罪分子，又可以防止久偵不決、久押不放的現象，更好地保護公民的合法權益。刑事訴訟中的存疑不起訴又可以稱之為證據不足不起訴，也就是說在司法機關收集到的證據里面，并不能直接的證明嫌疑人構成犯罪。于是在人民檢察院對刑事案件進行審查的時候，就會作出不予起訴的決定，而此時就是屬于存疑不起訴。而作出的不予起訴決定書需要公開宣布，同時需要將不予起訴的決定書送達相應的機關和人員。