職務犯罪的重要特點就 是犯罪行為與其職務密切相關，而職務又以一定機關為依托，因此工作單位所在地就成為地區管轄的重要參照物，故《人民檢察院刑事訴訟規則》第十五條規定：國 家工作人員職務犯罪案件，由犯罪嫌疑人工作單位所在地人民檢察院管轄；如果由其他人民檢察院管轄更為適宜的，可以由其他人民檢察院管轄。這一立案偵查模式 雖然有利于開展偵查工作，但隨著近些年反腐斗爭形勢的嚴峻，辦案工作日益受到犯罪嫌疑人關系網的干擾，給案件的查處帶來很大阻力。為了保證刑事訴訟的順利 進行，克服和排除各種非法干擾因素，目前檢察機關主要采取兩種措施應對，一是整合偵查資源，不再局限于當地職務犯罪案件由當地檢察機關的偵查人員查辦，主 要是地市級檢察院（有時是高檢、省檢）對所轄區域內的偵查人員統一調配使用；二是通過指定偵查管轄的形式，由不具有管轄權的異地檢察機關立案偵查案件。 按照目前職務犯罪案件 偵查指揮機制，上級檢察院將案件指定給不具有管轄權的下一級檢察院立案查處時，并不需要事先通知同級法院，偵查部門也不需要事先通知公訴部門。等到案件偵 查終結向本院公訴部門移送審查起訴時，上一級檢察院尚未與同級法院協商向下一級法院下達指定審判管轄的決定，因無上一級法院的指定管轄決定，檢察院不能直 接將案件向同級法院起訴，同級法院也無權直接受理，這時公訴部門就必須將該案的具體情況向上一級公訴部門匯報，再由上一級檢察機關公訴部門與同級法院刑事 審判部門協商，由上級法院指定下一級法院審判管轄；或者由同級法院先收下檢察院起訴的案件，再向上一級法院匯報，待上級法院出具指定管轄決定后，法院才正 式受理檢察機關的指控。 這兩種做法需要協調的 關系復雜，涉及到上下級檢察院之間、上下級法院之間、法院與檢察院之間、檢察院內部偵查部門與公訴部門之間多種關系的理順，而訴訟期限又是法定的，并不因 此而延長，故往往導致案件在審查起訴階段不能及時向法院起訴，或法院收案后不能及時受理，造成被告人在訴訟階段被超期羈押，損害了被告人的合法權利，其根 源在于法律條文的原則性和滯后性，導致司法實踐中無章可循。