銷售假藥犯罪和違法的非法經營有區別嗎？是有區別的；非法經營罪是指【非法經營罪】違反國家規定，有下列非法經營行為之一的犯罪。(一)未經許可經營法律、行政法規規定的專營、專賣物品或其他限制買賣的物品的;(二)買賣進出口許可證、進出口原產地證明以及其他法律、行政法規規定的經營許可證或者批準文件;(三)未經國家有關主管部門批準，非法經營證券、期貨或者保險業務的，或者非法從事資金結算業務的;(四)從事其他非法經營活動，擾亂市場秩序，情節嚴重的行為。非法經營罪中“違反國家規定”的理解第一個層次，如果一個行為沒有違反國家規定，而只是違反了比國家規定位階低的地方性法規、部門規章等，當然不構成非法經營罪;第二個層次，如果一個行為雖然違反了國家規定，但該國家規定未將該行為作“構成犯罪的…追究刑事責任”的規定、并且刑事司法解釋也未將該行為解釋為非法經營罪的行為方式的，也當然不構成非法經營罪。第三個層次，如果一個行為雖然違反了國家規定、并且該國家規定將該行為作“構成犯罪的…追究刑事責任”的規定，但刑事司法解釋未將該行為明確解釋為非法經營罪的行為方式的，也當然不構成非法經營罪――比如無照經營行為。二、生產、銷售假藥罪是生產者、銷售者違反國家藥品管理法規，生產、銷售假藥，足以危害人體健康的行為。生產、銷售假藥罪(刑法第141條)，是指生產者、銷售者違反國家藥品管理法規，生產、銷售假藥，足以危害人體健康的行為。根據刑法修正案八的規定，只要具有主觀故意生產、銷售假藥的行為，即構成本罪。綜合上面所說的，銷售假藥和非法的經營兩者都是屬于違反了我國的刑法條款，而且這種行為必定也會承擔刑法的責任，但對于兩者的處罰條款是不一樣的，適用的法律也會也會不一樣，從而承擔的責任也會不一樣，所以，在處理的時候就會按實際的情況來進行處理。