單位代扣個人所得稅工資多扣了怎么辦?1、與公司協商。公司扣工資的，應當說明扣工資的理由，甚至所依據的相關規章制度，且相關規章制度是已經過事前公開公示，否則，公司屬于無正當理由克扣工資，屬于無理的違法行為，職工可以要求公司全額支付工資及相應利息損失。2、如協商不成的，可以到當地的勞動監察大隊投訴，要求協助處理解決。3、如仍未解決的，可以至當地的勞動仲裁機構申請勞動仲裁處理解決。4、如勞動仲裁生效后，公司拒絕執行并拒付的，可以申請法院強制執行。法律依據:《勞動法》第五十條，工資應當以貨幣形式按月支付給勞動者本人。不得克扣或者無故拖欠勞動者的工資。二、拖欠工資的處罰承擔民事責任和行政責任，情節嚴重的，追究刑事責任。1、用人單位未按照勞動合同的約定或國家規定及時足額支付勞動者勞動報酬的，由勞動行政部門責令限期支付勞動報酬、加班費或經濟補償金，逾期不支付的，責令用人單位按應付金額百分之五十以上百分之一百以下的標準向勞動者加付賠償金。用人單位低于當地最低工資標準支付勞動者工資的，應當支付其差額部分，逾期不支付的，責令用人單位按應付金額百分之五十以上百分之一百以下的標準向勞動者加付賠償金。2、以轉移財產、逃匿等方法逃避支付勞動報酬或有能力支付而不支付勞動報酬，數額較大，經政府有關部門責令支付仍不支付的，處三年以下有期徒刑或者拘役，并處或者單處罰金;造成嚴重后果的，處三年以上七年以下有期徒刑，并處罰金。個人所得稅稅率是法定的，所以，并不是說用人單位想扣多少就隨便能扣多少，被公司多扣去的這部分工資，如果公司給不出合理的解釋，按照法律規定，公司必須要補發克扣的工資，逾期不補發的還要支付賠償金。