股權轉讓協議如何處理？ 一、股權轉讓協議有哪些注意事項？ 1、如何確定股權轉讓價格 對股權轉讓價格的評估應當區分國有企業，與一般私營有限責任公司的不同。前者必須經過國有資產辦對股權進行立項、確認的步驟，再到資產評估機構進行評估。而后者因為允許雙方通過協商來確定，因此比較自由。但即使是協商，也至少應當保證該價格的產生是經過了雙方認可并有實際依據的。 2、轉讓方應當作出股權無瑕疵的書面保證 由于股權存在瑕疵而引起的爭議糾紛相當常見，在簽訂股權轉讓協議之時就要求轉讓方對其轉讓資格、轉讓的股權作無瑕疵保證，一旦未來產生爭議，至少能提醒法官受讓方在簽訂協議之初就已盡到了應盡的注意義務。 3、轉讓方繳稅保證與配合變更登記保證 很多股權轉讓協議中雙方都習慣作出“本次股權轉讓過程中產生的一切費用都由轉讓方/受讓方承擔”等類似籠統的約定，但該約定并不能免除轉讓方繳稅的法定義務。根據相關法律規定，股權轉讓過程中，股權轉讓人是納稅義務人，受讓人是代扣代繳義務人，納稅人應當按照財產轉讓所得的20%繳納個人所得稅。所以如果雙方僅約定了“一切費用的承擔方”，該“一切費用”一般不包括轉讓方應當繳納的個人所得稅，對此司法審判中還是有一定共識的。 4、明確公司債權債務的承擔方 二、非法的股權轉讓協議如何處理？ 有些受讓方因為股權轉讓價格過低而急于受讓，卻可能忽視了該股權背后隱藏的風險，即公司的債務情況。公司所承擔的債務直接影響到公司的資產、股權的價值、公司的運營及盈利能力，因此對公司現存的債務如何承擔是需要在股權轉讓協議中特別約定，也是非常重要的條款。 股權轉讓通常通過轉讓人與受讓人以訂立股權轉讓合同的形式進行，股權轉讓合同是股權變動的載體。轉讓人與受讓人就轉讓股份的數量、價格、付款期限、方式等內容達成一致意見并簽訂股權轉讓合同的行為，是股權轉讓過程中債權行為的具體體現。就此而言，股權轉讓合同與一般民商事合同并無區別，應受合同法及相關法律的調整，而股權轉讓合同的效力也首先應當適用合同法的有關規定加以判斷。 與一般合同不同的是，股權轉讓合同的簽訂與履行不僅影響合同雙方當事人的切身利益，而且涉及合同當事人之外的利益相關者，包括公司、債權人等的切身利益。因為，股權轉讓合同一旦履行，不僅在合同雙方當事人間發生對價給付，受讓方亦有可能參與公司經營管理，改變公司經營理念、經營方針和經營策略，若股權轉讓合同被確認無效或撤銷，必然在合同雙方當事人、公司及利益相關者間掀起軒然大波。因此，在股權轉讓合同糾紛案件中，對于股權轉讓合同效力的確認應慎重對待，從嚴把握。 綜上所述，股權轉讓協議對于雙方來說非常重要，在簽訂股權轉讓協議的時候要從合同主體、股東會意見、明晰股權結構等幾方面注意。對于不合法的股權轉讓協議如何處理，有不同的處理方式，一方可以申請協議無效，不予履行，或者通過民事訴訟解決，由法院強制判決協議無效。