與濫用職權(quán)罪（刑法第三百九十七條）相比，本罪的主體是國有公司、企業(yè)的工作人員，侵犯的客體是國有公司的財產(chǎn)權(quán)益和社會主義市場經(jīng)濟秩序；而濫用職權(quán)罪的主體是國家機關(guān)工作人員，侵犯的客體是國家機關(guān)的正常管理活動.。‌例如，在國有公司中，管理人員濫用職權(quán)減免費用的行為，若主體為國有公司人員，則適用國有公司、企業(yè)人員濫用職權(quán)罪。‌

與徇私舞弊低價折股、出售國有資產(chǎn)罪（刑法第一百六十九條）的區(qū)別在于，后者特指在企業(yè)改制或國有資產(chǎn)處理過程中，故意低價折股、出售國有資產(chǎn)的行為，而本罪范圍更廣，涵蓋一般濫用職權(quán)行為。‌
與受賄罪的關(guān)聯(lián)在于，實踐中可能并存，但需分別定罪，如國有公司人員濫用職權(quán)減免費用并收受好處的，可能同時構(gòu)成濫用職權(quán)罪和受賄罪。‌
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