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企業股權變更主要表現為股權的投資轉讓，根據法律的相關規定，企業股權的轉讓行為，轉讓方需要按照其
股權轉讓所得計征企業所得稅。以轉讓股權的收入減去原值和相關費用后的余額，其繳納的稅率適用于百分之二十的比例稅率，計算繳納企業所得稅。但是，如果企業以原價轉讓的股權的話，那么則不需要繳納企業所得稅。如果
股權轉讓涉及到企業所得稅，那么根據《國家稅務總局關于企業股權投資業務若干所得稅問題的通知》的規定，企業股權投資轉讓所得和損失的所得稅處理方法如下所示：企業因為收回、轉讓以及清算等方式對股權進行處置后，所獲取的收入減去股權投資成本后的余額，即為企業股權投資轉讓所得或損失。那么這部分如果是正數的話，所得就應該計入企業的應納稅所得額里，依法繳納相應的企業所得稅。繳納金額的計算方法。根據《中華人民共和國稅收征收管理法》第三十五條的規定，如果納稅人存在下列情形之一的，稅務機關有權對其應繳納稅額進行核定。(一)根據法律規定，納稅人可以不設置賬簿的情況，稅務機關有權核定其應納稅額。(二)根據法律規定應該設置帳簿但是納稅人沒有設置的，稅務機關有權對其應納稅額進行核定。(三)納稅人擅自將賬簿銷毀了的、納稅人拒不提供相應的納稅資料的，稅務機關有權對其應納稅額進行核定。(四)納稅人設置了賬簿但對賬簿內容記錄不認真，敷衍了事，賬目混亂不堪，或者是對有關成本的資料、收入憑證等殘缺不全的，造成查賬困難的，稅務機關有權核定其應納稅額。(五)納稅人產生了納稅的義務但是沒有在規定期限內申報辦理納稅，稅務機關對其責令限期申報卻有逾期不申報的，稅務機關有權核定其應納稅額。(六)納稅人沒有正當理由說明其申報的計稅依據明顯偏低的，稅務機關有權核定其應納稅額。關于稅務機關具體如何核定應納稅額，就需要國務院稅務主管部門來規定。股權變更后需要申報辦理變更稅務登記的，應當在工商行政管理機關變更登記那一天起算的三十天內，帶好證件在市地稅登記機關申報辦理。當然，如果是經其他有關機關批準或這宣布變更了的或是稅務登記實際發生變化了的，時間還是以那一天起算的三十天內。如果企業自然人的股東股權需要變更的，那么其原主管的稅務機關需要在其《變更稅務(社保繳費)登記表》上加上自己的審批意見，然后就可以去登記分局大廳或登記外點辦理變更手續。對于自然人股東來說，需要依據《中華人民共和國個人所得稅法》的規定，原股東獲得的
股權轉讓所得，需要財產轉讓所得項目征收個人所得稅，其適用的稅率為20%。財產轉讓所得以每次轉讓財產取得的收入總數額減除財產原值和其他費用的余額作為應納稅所得額。
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